MongoDB允许深入文档内部，对嵌套字段和数组建立索引；嵌套对象和数组字段可以和复合索引中的顶级字段一起使用，多数情况下与“正常”索引字段的行为也是一致的。

一、索引嵌套文档

例如，集合中的文档如下格式，

> db.post.findOne({"username":"sid"})   
{    
    "_id" : ObjectId("54aff7f43bd1048e7b585e39"),    
    "username" : "sid",    
    "loc" : {    
        "ip" : "1.2.3.4",    
        "city" : "springfield",    
        "state" : "ny"    
    }    
}    
>

需要在“loc”的city上建立索引来提高这个loc.city字段的查询速度：

> db.post.ensureIndex({"loc.city":1})   
{    
    "createdCollectionAutomatically" : false,    
    "numIndexesBefore" : 1,    
    "numIndexesAfter" : 2,    
    "ok" : 1    
}    
>

利用这种方式可以建立任意深度的索引，例如可以在X.Y.Z.A.B.C上建立索引。

但是，针对子文档“loc”上建立的索引，和建立在子文档的某个字段“loc.city”上的索引是不同的：

（1）对整个子文档上建立的索引，只会提高整个子文档的的查询速度；也就是说只有在完全匹配子文档的查询（包括字段顺序），子文档索引才会起作用；

（2）只有查询loc.city字段，索引loc.city才会起作用，其他情况索引loc.city不起作用；

二、数组上的索引

（1）可以看得出在数组字段上建立索引的代价比较大，因为每次的删除，更新都会对每一个索引进行刷新，太消耗服务器的资源；

（2）可以针对数组字段中的某一个元素做具体的单独索引，减少索引的数量；例如，在数组字段comments中的第九个元素中的votes上建立索引：

> db.post.ensureIndex({"comment.10.votes":1})

同样，只有精确匹配comment.10.votes查询，上述索引才会起到索引的作用。

三、多键索引

如果在数组字段上创建索引，那么这个索引称为多键索引（ multikey）。

多键索引用explain函数中可以看到“isMultikey”字段的值为true，多键索引比非多键索引要慢一些；