首先请到官网下载对应的版本
解压到apps目录下: 并且重命名为:phpMyAdmin-4.6.3

更改D:\wamp\alias\phpmyadmin.conf 文件,把1、13行修改成对应的目录

重启服务或者重启电脑
另外重启后可能会出现 #1045 - Access denied for user ‘root’@’localhost’ (using password: YES)

解决方法:
把D:\wamp\apps老版本目录下的config.inc.php文件复制到新的phpmyadmin目录下面

更改D:\wamp目录下的wampmanager.conf文件,在文件底部的[apps]中改成你的新版本号

最后重启服务即可。